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과세예고통지와 과세전적부심사 기회 침해, 그리고 감면세액 추징의 부과제척기간 기산일
영어 원문을 옮긴 글입니다. 영어 원문 보기
대법원 2025. 12. 4. 선고 2025두34254 판결
사건명: 법인세부과처분무효확인
쟁점
관할 세무서장이 과세예고통지를 하고 납세자의 과세전적부심사 청구기간이 도과하기 전에 같은 날 법인세를 경정·고지한 것이 위법한지, 그리고 본점 소재지를 수도권으로 다시 이전함에 따라 생긴 법인세 납부의무의 부과제척기간 기산일은 어느 날인가?
판단
그렇습니다. 과세예고통지는 납세자에게 정보를 미리 알려 준비하여 의견을 진술할 기회를 갖도록 하는 처분의 사전통지로서의 실질을 가지며, 헌법 제12조 제1항의 적법절차 원칙은 세무공무원이 과세권을 행사할 때에도 준수되어야 합니다. 과세예고통지의 대상에서 제외되거나 과세전적부심사를 거치지 않고 바로 과세처분할 수 있는 예외사유에 해당한다는 특별한 사정이 없는데 청구나 결정이 있기 전에 처분하였다면, 이는 중대한 절차적 하자로서 과세처분의 효력을 부정하는 방법으로 통제할 수밖에 없으므로 그 처분은 위법합니다. 구 국세기본법 시행령 제12조의3 제2항 제3호는 의무의 이행을 조건으로 혜택을 받은 후 추징하는 경우나 이에 준하는 경우에 적용되고, ‘해당 공제세액 등을 징수할 수 있는 사유가 발생한 날’은 의무불이행이 이루어진 시점 자체가 아니라 과세관청이 징수절차에 나아갈 수 있게 된 날입니다. 이 사건에서는 그 날이 2018. 4. 1.이고 5년의 부과제척기간 만료일은 2023. 3. 31.이며, 2022. 6. 21. 과세예고통지로부터 그 만료일까지 3개월을 초과합니다.
판결요지 원문
과세예고통지 후 과세전적부심사 청구 또는 그에 대한 결정이 있기도 전에 과세처분을 하였다면, 이는 납세자의 절차적 권리를 침해한 것으로서 과세처분의 효력을 부정하는 방법으로 통제할 수밖에 없는 중대한 절차적 하자가 존재하는 경우에 해당하므로, 그 과세처분은 위법하다고 보아야 한다.
결론
기각 판결문이 밝힘
상고를 기각한다. 상고비용은 피고가 부담한다.
판단 기준의 형태
요건 제시 판결문이 밝힘
여기에서 ‘해당 공제세액 등을 징수할 수 있는 사유가 발생한 날’은 의무불이행 등이 이루어진 시점 자체를 의미하는 것이 아니라 의무불이행 등을 사유로 하여 과세관청이 징수절차에 나아갈 수 있게 된 날을 의미한다고 봄이 타당하다.
판단 요소
- 과세예고통지 후 과세전적부심사 청구 또는 그에 대한 결정이 있기도 전에 과세처분을 하였다면
- 과세처분의 효력을 부정하는 방법으로 통제할 수밖에 없는 중대한 절차적 하자가 존재하는 경우에 해당하므로
- 납세의무자가 일정한 의무의 이행을 조건으로 세액공제 등의 혜택을 받은 후 그 의무를 이행하지 않아 과세관청이 공제세액 등을 추징하는 경우나 이에 준하는 경우에 적용되는 규정으로서
- 본점 소재지를 다시 수도권으로 이전한 날인 2017. 7. 5.이 아니라 2017 사업연도 법인세 신고기한의 다음 날인 2018. 4. 1.로 보아야 하므로
- 과세예고통지가 이루어진 2022. 6. 21.로부터 위 부과제척기간 만료일까지의 기간이 3개월을 초과하므로
선례 관계
기존 판례 따름 판결문이 밝힘
대법원 2016. 4. 15. 선고 2015두52326 판결(공2016상, 657)
참조판례
[1] 대법원 2016. 4. 15. 선고 2015두52326 판결(공2016상, 657), 대법원 2016. 12. 27. 선고 2016두49228 판결(공2017상, 257) / [2] 대법원 2022. 11. 17. 선고 2019두51512 판결(공2023상, 65)
증명 책임
언급 없음 판결문에 없음
남은 물음과 재검토 조건
추징을 부르는 의무불이행이 이후 세무조사에서 비로소 드러날 때, 구 국세기본법 시행령 제12조의3 제2항 제3호의 ‘해당 공제세액 등을 징수할 수 있는 사유가 발생한 날’은 어느 날인가?
의무불이행이 세무조사에서 발견된 경우 과세관청이 징수절차에 나아갈 수 있는 날을 정하는 후속 판결이 나오면 이 사건에 적용된 기산일이 달라집니다. 국세기본법 제81조의15나 같은 법 시행령 제12조의3이 개정되면 이 기록을 다시 읽어야 합니다.
교차 계열 AI 독립 판독 및 축별 대조
8개 축 중 7개 축 일치 GPT-6 Astra (OpenAI, codex CLI) · 2026-10-24
다른 계열 AI(GPT-6 Astra)가 1차 판독을 보지 않고 원문만 읽은 독립 판독과 대조한 결과 8개 축 중 7개 축이 일치했고, 제8축(남은 물음과 재검토 조건)에서 읽기가 갈렸습니다.
제8축(남은 물음과 재검토 조건): 1차 판독 "추징을 부르는 의무불이행이 이후 세무조사에서 비로소 드러날 때, 구 국세기본법 시행령 제12조의3 제2항 제3호의 ‘해당 공제세액 등을 징수할 수 있는 사유가 발생한 날’은 어느 날인가?" vs 독립 판독 "부과제척기간의 기산일이 실제로 불명확한 경우에도 같은 절차적 하자의 명백성이 반드시 인정되는가?"
1차 판독은 뒤늦은 발견이 부과제척기간 기산일에 미치는 영향을 묻고, 독립 판독은 기산일의 불명확성이 하자의 명백성 인정을 막는지 묻는다.
과세예고통지 후 과세전적부심사 청구 또는 그에 대한 결정이 있기도 전에 과세처분을 하였다면, 이는 납세자의 절차적 권리를 침해한 것으로서 과세처분의 효력을 부정하는 방법으로 통제할 수밖에 없는 중대한 절차적 하자가 존재하는 경우에 해당하므로, 그 과세처분은 위법하다고 보아야 한다.원 응답과 대조 기록: 실행 조건 · 블라인드 판독 원본(JSONL) · 축별 대조 원본(JSONL) · SHA-256 목록(JSON)
심급별 판단 구조 및 선례 적용 범위(Distinguishing)
원심 판단과 대법원 법리의 대조
심급별 쟁점 배경: 원심인 수원고등법원 2025. 6. 13. 선고 2024누11231 판결은 구 조세특례제한법 제63조의2가 감면세액을 그 사유가 발생한 과세연도의 과세표준신고 시 신고납부하도록 정한 것으로 보았습니다. 그래서 기산일을 2018. 4. 1., 5년의 부과제척기간 만료일을 2023. 3. 31.로 정했고, 2022. 6. 21. 과세예고통지로부터 그 만료일까지 3개월을 초과하므로 국세기본법 제81조의15 제3항 제3호의 예외에 해당하지 않으며, 과세예고통지와 같은 날 처분한 것은 과세전적부심사의 기회를 침해한 것이라고 판단했습니다.
대법원의 판단 기준: 대법원은 원심 판단에 잘못이 없다고 보았습니다. 과세예고통지와 과세전적부심사가 예방적 구제제도이고 헌법 제12조 제1항의 적법절차 원칙이 과세권 행사에도 준수되어야 한다는 법리를 대법원 2016. 4. 15. 선고 2015두52326 판결과 대법원 2016. 12. 27. 선고 2016두49228 판결에 따라 다시 밝혔습니다. 구 국세기본법 시행령 제12조의3 제2항 제3호의 해석도 대법원 2022. 11. 17. 선고 2019두51512 판결에 따라 수긍하였고, 원심이 법리를 오해한 잘못이 없다고 하여 상고를 기각하고 상고비용은 피고가 부담하도록 했습니다. 관여 대법관의 일치된 의견으로 판결했습니다.
선례 적용 시 구별할 사안의 경계(Distinguishing)
- 과세조사 결과 통지 및 과세예고통지일부터 부과제척기간 만료일까지의 기간이 3개월 이하인 과세처분으로, 국세기본법 제81조의15 제3항 제3호에 따라 과세전적부심사를 거치지 않고 곧바로 과세처분할 수 있는 경우
- 과세예고통지를 하여 30일의 청구기간이 지난 뒤에 과세처분하여 청구나 그에 대한 결정이 없던 경우
- 국세기본법 제81조의15 제3항의 다른 예외사유에 해당하는 과세처분으로, 국세징수법 제9조의 납부기한 전 징수 사유가 있거나 조세범 처벌법 위반으로 고발 또는 통고처분하는 경우
기록 대조 및 검토 사항
과세조사 결과 통지 및 과세예고통지일과 부과제척기간 만료일을 대조합니다. 예외 여부가 그 사이가 3개월 이하인지에 달려 있기 때문입니다. 이어 기산일을 과세관청이 징수절차에 나아갈 수 있게 된 날로 정하고, 2019. 2. 12. 대통령령 제29534호로 개정되기 전의 구 국세기본법 시행령과 2017. 12. 19. 법률 제15227호로 개정되기 전의 구 조세특례제한법이 적용되는지 확인합니다. 기록에서 납세자가 30일의 청구기간 내에 청구할 기회를 실제로 잃었는지도 살핍니다.
판결 원문 발췌
판시사항
[1] 과세예고통지 및 과세전적부심사 제도의 의의 / 과세관청이 과세예고통지를 하지 않거나 과세예고통지 후 과세전적부심사 청구나 그에 대한 결정이 있기 전에 과세처분을 한 경우, 과세처분이 위법한지 여부(원칙적 적극) [2] 구 국세기본법 시행령 제12조의3 제2항 제3호는 납세의무자가 일정한 의무를 이행할 것을 조건으로 세액공제 등의 혜택을 받은 후 당초의 의무를 이행하지 않아 과세관청이 공제세액 등을 추징하는 경우나 이에 준하는 경우에만 적용되는 규정인지 여부(적극) 및 여기에서 ‘해당 공제세액 등을 징수할 수 있는 사유가 발생한 날’의 의미 [3] 갑 주식회사가 본점 소재지를 수도권 밖으로 이전하여 구 조세특례제한법 제63조의2에 따라 법인세를 감면받은 후 2017. 7. 5. 본점 소재지를 다시 수도권으로 이전하자 2022. 6. 21. 관할 세무서장이 감면세액 추징을 위하여 법인세를 경정·고지 및 과세예고통지를 한 사안에서, 관할 세무서장이 갑 회사의 과세전적부심사 청구기간이 도과하기 전에 위 과세예고통지일과 같은 날 처분을 한 것은 과세전적부심사의 기회를 침해한 것으로서 중대하고 명백한 하자에 해당한다고 본 원심판단을 수긍한 사례
판결요지
[1] 과세예고통지는 과세관청이 조사한 사실 등의 정보를 미리 납세자에게 알려줌으로써 납세자가 충분한 시간을 가지고 준비하여 과세전적부심사와 같은 의견청취절차에서 의견을 진술할 기회를 가짐으로써 자신의 권익을 보호할 수 있도록 하기 위한 처분의 사전통지로서의 실질을 가진다. 또한 과세처분 이후에 행하여지는 심사·심판청구나 행정소송은 시간과 비용이 많이 소요되어 효율적인 구제수단으로 미흡한 측면이 있다는 점과 대비하여 볼 때, 과세전적부심사 제도는 과세관청이 위법·부당한 처분을 행할 가능성을 줄이고 납세자도 과세처분 이전에 자신의 주장을 반영할 수 있도록 하는 예방적 구제제도의 성질을 가질 뿐만 아니라, 위법한 처분은 물론 부당한 처분도 심사대상으로 삼고 있어 행정소송과 같은 사후적 구제절차에 비하여 권리구제의 폭이 넓다. 이와 같이 사전구제절차로서 과세예고통지와 과세전적부심사 제도가 가지는 기능과 이를 통해 권리구제가 가능한 범위, 이러한 제도가 도입된 경위와 취지, 납세자의 절차적 권리 침해를 효율적으로 방지하기 위한 통제방법과 더불어, 헌법 제12조 제1항에서 규정하고 있는 적법절차의 원칙은 세무공무원이 과세권을 행사하는 경우에도 마찬가지로 준수해야 하는 점 등을 고려하여 보면, 국세기본법 및 국세기본법 시행령이 과세예고통지의 대상으로 삼고 있지 않다거나 과세전적부심사를 거치지 않고 곧바로 과세처분을 할 수 있는 예외사유로 정하고 있다는 등의 특별한 사정이 없는데도 과세관청이 과세처분에 앞서 필수적으로 해야 할 과세예고통지를 하지 않음으로써 과세전적부심사의 기회를 부여하지 아니한 채 과세처분을 하였거나 과세예고통지 후 과세전적부심사 청구 또는 그에 대한 결정이 있기도 전에 과세처분을 하였다면, 이는 납세자의 절차적 권리를 침해한 것으로서 과세처분의 효력을 부정하는 방법으로 통제할 수밖에 없는 중대한 절차적 하자가 존재하는 경우에 해당하므로, 그 과세처분은 위법하다고 보아야 한다. [2] 구 국세기본법 시행령(2019. 2. 12. 대통령령 제29534호로 개정되기 전의 것, 이하 같다) 제12조의3 제1항 제1호, 제2항 제3호의 문언과 체계 및 입법 취지 등을 종합적으로 고려하면, 구 국세기본법 시행령 제12조의3 제2항 제3호는 납세의무자가 일정한 의무의 이행을 조건으로 세액공제 등의 혜택을 받은 후 그 의무를 이행하지 않아 과세관청이 공제세액 등을 추징하는 경우나 이에 준하는 경우에 적용되는 규정으로서, 여기에서 ‘해당 공제세액 등을 징수할 수 있는 사유가 발생한 날’은 의무불이행 등이 이루어진 시점 자체를 의미하는 것이 아니라 의무불이행 등을 사유로 하여 과세관청이 징수절차에 나아갈 수 있게 된 날을 의미한다고 봄이 타당하다. [3] 갑 주식회사가 본점 소재지를 수도권 밖으로 이전하여 구 조세특례제한법(2017. 12. 19. 법률 제15227호로 개정되기 전의 것) 제63조의2에 따라 법인세를 감면받은 후 2017. 7. 5. 본점 소재지를 다시 수도권으로 이전하자 2022. 6. 21. 관할 세무서장이 감면세액 추징을 위하여 법인세를 경정·고지 및 과세예고통지를 한 사안에서, 법인세 납부의무에 관한 부과제척기간 기산일은 구 국세기본법 시행령(2019. 2. 12. 대통령령 제29534호로 개정되기 전의 것) 제12조의3 제2항 제3호의 해석상 본점 소재지를 다시 수도권으로 이전한 날인 2017. 7. 5.이 아니라 2017 사업연도 법인세 신고기한의 다음 날인 2018. 4. 1.로 보아야 하므로 법인세 납부의무에 관한 부과제척기간 만료일은 그로부터 5년이 지난 2023. 3. 31.이라 할 것인데, 과세예고통지가 이루어진 2022. 6. 21.로부터 위 부과제척기간 만료일까지의 기간이 3개월을 초과하므로, 국세기본법 제81조의15 제3항 제3호에 따라 과세전적부심사를 거치지 않고 곧바로 과세처분을 할 수 있는 예외사유에 해당하지 않는다는 이유로, 관할 세무서장이 갑 회사의 과세전적부심사 청구기간이 도과하기 전에 위 과세예고통지일과 같은 날 처분을 한 것은 과세전적부심사의 기회를 침해한 것으로서 중대하고 명백한 하자에 해당한다고 본 원심판단을 수긍한 사례.
주문
상고를 기각한다. 상고비용은 피고가 부담한다.
참조조문
[1] 헌법 제12조 제1항, 국세기본법 제81조의15 / [2] 구 국세기본법 시행령(2019. 2. 12. 대통령령 제29534호로 개정되기 전의 것) 제12조의3 제1항 제1호, 제2항 제3호 / [3] 국세기본법 제81조의15, 구 국세기본법 시행령(2019. 2. 12. 대통령령 제29534호로 개정되기 전의 것) 제12조의3 제1항 제1호, 제2항 제3호, 구 조세특례제한법(2017. 12. 19. 법률 제15227호로 개정되기 전의 것) 제63조의2
판독 2026-10-24 · 교차 판독 2026-10-24. 인용 구절을 모두 판결 원문과 대조했습니다. 판결문이 한자로 쓴 가명은 한글 읽기(갑, 을, 병)로 옮기고, 한자 괄호 풀이는 뺐습니다.
인용한 구절이 모두 판결 원문과 한 글자씩 일치하는지 대조를 마친 기록만 싣고, 다른 계열 AI의 독립 판독으로 8개 축 전체를 교차 검증합니다. 두 계열 판독이 일치한 축과 판결문 문언의 초점에 따라 해석이 갈린 축을 모두 투명하게 공개합니다. 이 대장은 연구 기록이며, 법원에 대한 평가나 특정 사건에 대한 조언이 아닙니다.
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