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거래순이익률방법과 유지보수서비스 지원 거래의 독립성

영어 원문을 옮긴 글입니다. 영어 원문 보기

대법원 2025. 10. 16. 선고 2024두54065 판결

사건명: 법인세부과처분취소

국가법령정보센터 판결 원문

  1. 쟁점

    구 국제조세조정에 관한 법률에 따라 거래순이익률방법을 적용한 과세관청이 산출한 정상가격을, 의료장비 공급 거래와 별도로 존재한다고 주장되는 유지보수서비스 지원 거래에 대한 조정을 따로 하지 않았다는 이유만으로 틀렸다고 단정할 수 있는가?

  2. 판단

    상품이나 거래단계의 차이가 현저하여 양자가 본질적으로 다르고, 그로 인하여 거래에 수반되는 위험이나 사용되는 자산 등 다른 비교 가능성 분석요소의 차이를 야기하며, 나아가 그러한 차이가 영업이익률에 중대한 영향을 미친다면, 합리적인 차이 조정이 이루어지지 아니하는 한 그 비교대상거래는 비교 가능성이 높다고 할 수 없어 그 거래를 기초로 거래순이익률방법에 따라 산출한 가격은 적법한 정상가격이라고 할 수 없습니다. 과세관청이 당해 거래의 조건과 상황이 유사한 거래를 행하는 비교대상업체를 선정하고 최선의 노력으로 확보한 자료에 기하여 합리적으로 정상가격을 산출하였다면, 특별한 사정이 없는 한 거래품목이나 거래단계 등 차이에 따른 별도의 조정을 하지 아니하였다는 이유만으로 그와 같이 산출한 정상가격이 틀렸다고 단정할 수는 없습니다. 이 사건에서 대법원은 의료장비 공급 거래와 별도로 독립적인 유지보수서비스 지원 거래가 존재한다고 보기 어렵다고 보아, 피고가 그 거래를 조정 대상 국제거래로 특정하고 비교 가능성을 평가하는 과정을 반드시 거쳤어야 한다고 볼 수 없다고 하였습니다.

    판결요지 원문

    거래순이익률방법을 적용하여 정상가격을 산출하는 경우, 과세관청이 당해 거래의 조건과 상황이 유사한 거래를 행하는 비교대상업체를 선정하고 최선의 노력으로 확보한 자료에 기하여 합리적으로 정상가격을 산출하였다면, 특별한 사정이 없는 한 거래품목이나 비교대상업체와의 거래단계 등 차이에 따른 별도의 조정을 하지 아니하였다는 이유만으로 그와 같이 산출한 정상가격이 틀렸다고 단정할 수는 없다.
  3. 결론

    파기환송 판결문이 밝힘

    원심판결을 파기하고, 사건을 서울고등법원에 환송한다.
  4. 판단 기준의 형태

    요건 제시 판결문이 밝힘

    국외특수관계자거래와 비교대상거래 사이에 상품이나 거래단계의 차이가 현저하여 양자가 본질적으로 다르고, 그로 인하여 거래에 수반되는 위험이나 사용되는 자산 등 다른 비교 가능성 분석요소의 차이를 야기하며, 나아가 그러한 차이가 영업이익률에 중대한 영향을 미친다면
  5. 판단 요소

    • 과세관청이 당해 거래의 조건과 상황이 유사한 거래를 행하는 비교대상업체를 선정하고 최선의 노력으로 확보한 자료에 기하여 합리적으로 정상가격을 산출하였다면
    • 유지보수서비스업 매출은 대부분 유지보수서비스 용역 자체가 아니라 부품 판매에서 발생하였고
    • 대부분의 의료장비 고장은 국내 엔지니어들에 의해 해결되는 등 ‘유지보수서비스 지원 거래’라는 것이 국내에서의 유지보수서비스업과 관련된 다국적기업 차원의 기본적 제도 및 정책에 불과한 점
    • 갑 회사와 국외특수관계인들은 의료장비 및 부품 공급 거래를 할 때와 달리 ‘유지보수서비스 지원’에 관해서는 계약서를 따로 작성하지 않은 점
  6. 선례 관계

    기존 판례 따름 판결문이 밝힘

    대법원 2014. 9. 4. 선고 2012두1747, 1754 판결(공2014하, 2063)

    참조판례

    [1] 대법원 2014. 8. 20. 선고 2012두23341 판결(공2014하, 1894) / [2] 대법원 2014. 9. 4. 선고 2012두1747, 1754 판결(공2014하, 2063)

  7. 증명 책임

    언급 없음 판결문에 없음

  8. 남은 물음과 재검토 조건

    국외특수관계인의 유지보수서비스 지원이 영업이익률에 중대한 영향을 미칠 정도로 기여하였음을 보여 독립적인 국제거래가 존재한다고 볼 수 있는 증거는 무엇인가?

    환송 후 서울고등법원이 의료장비 사업 부문의 법인세를 다시 산출하는 판결이 나오면 이 기준이 이 사건 사실관계에 어떻게 적용되는지 드러납니다. 국제조세조정에 관한 법률이나 그 시행령이 개정되거나 현행법 제7조 제1항·제2항, 제8조에 관한 후속 판결이 나오면 이 기록을 다시 읽어야 합니다.

교차 계열 AI 독립 판독 및 축별 대조

8개 축 중 6개 축 일치 GPT-6 Astra (OpenAI, codex CLI) · 2026-10-24

다른 계열 AI(GPT-6 Astra)가 1차 판독을 보지 않고 원문만 읽은 독립 판독과 대조한 결과 8개 축 중 6개 축이 일치했고, 제5축(판단 요소), 제8축(남은 물음과 재검토 조건)에서 읽기가 갈렸습니다.

제5축(판단 요소): 1차 판독 "과세관청이 당해 거래의 조건과 상황이 유사한 거래를 행하는 비교대상업체를 선정하고 최선의 노력으로 확보한 자료에 기하여 합리적으로 정상가격을 산출하였다면 / 유지보수서비스업 매출은 대부분 유지보수서비스 용역 자체가 아니라 부품 판매에서 발생하였고 / 대부분의 의료장비 고장은 국내 엔지니어들에 의해 해결되는 등 ‘유지보수서비스 지원 거래’라는 것이 국내에서의 유지보수서비스업과 관련된 다국적기업 차원의 기본적 제도 및 정책에 불과한 점 / 갑 회사와 국외특수관계인들은 의료장비 및 부품 공급 거래를 할 때와 달리 ‘유지보수서비스 지원’에 관해서는 계약서를 따로 작성하지 않은 점" vs 독립 판독 "상품이나 거래단계의 차이가 현저하여 양자가 본질적으로 다르고 / 거래에 수반되는 위험이나 사용되는 자산 / 그러한 차이가 영업이익률에 중대한 영향을 미친다면 / 최선의 노력으로 확보한 자료"

1차 판독은 별도 유지보수서비스 지원 거래의 존재를 부정하는 사실을 강조하고 독립 판독은 상품 차이, 위험, 자산, 이익률 영향을 강조하여 주로 최선의 노력으로 확보한 자료라는 요소만 공유한다.

상품이나 거래단계의 차이가 현저하여 양자가 본질적으로 다르고

제8축(남은 물음과 재검토 조건): 1차 판독 "국외특수관계인의 유지보수서비스 지원이 영업이익률에 중대한 영향을 미칠 정도로 기여하였음을 보여 독립적인 국제거래가 존재한다고 볼 수 있는 증거는 무엇인가?" vs 독립 판독 "환송심에서 선정된 비교대상업체와 확보된 자료를 토대로 과세에 사용된 정상가격의 합리성이 최종적으로 인정될 것인가?"

1차 판독은 어떤 증거로 독립적인 유지보수서비스 지원 거래를 인정할 수 있는지 묻고, 독립 판독은 환송심에서 과세에 사용된 정상가격의 합리성이 최종적으로 인정될지 묻는다.

거래순이익률방법을 적용하여 정상가격을 산출하는 경우, 과세관청이 당해 거래의 조건과 상황이 유사한 거래를 행하는 비교대상업체를 선정하고 최선의 노력으로 확보한 자료에 기하여 합리적으로 정상가격을 산출하였다면, 특별한 사정이 없는 한 거래품목이나 비교대상업체와의 거래단계 등 차이에 따른 별도의 조정을 하지 아니하였다는 이유만으로 그와 같이 산출한 정상가격이 틀렸다고 단정할 수는 없다.

원 응답과 대조 기록: 실행 조건 · 블라인드 판독 원본(JSONL) · 축별 대조 원본(JSONL) · SHA-256 목록(JSON)

심급별 판단 구조 및 선례 적용 범위(Distinguishing)

원심 판단과 대법원 법리의 대조

심급별 쟁점 배경: 원심인 서울고등법원 2024. 8. 21. 선고 2022누55844 판결은 확보·이용 가능성이 높지 않은 자료를 사용했다는 원고의 주장을 배척하면서도, 피고의 비교대상업체 선정과 정상가격 산출이 의료장비 및 소형가전 사업 부문에서 적법하게 이루어진 것으로 볼 수 없다고 판단했습니다. 의료장비 사업 부문에서는 국제거래가 의료장비 공급 거래와 유지보수서비스 지원 거래 모두이므로 비교 가능성을 분석했어야 하고, 그 과정을 거쳤다고 볼 근거가 부족하다고 보았습니다. 소형가전 사업 부문에서는 해외 제조사 제품을 수입해 자체 마케팅 전략으로 수익을 창출하는 업체들이 원고와 동일한 완전판매업자라고 단정하기 어렵다고 보았습니다.

대법원의 판단 기준: 대법원은 소형가전 사업 부문에 관한 원심 판단은 이유 설시에 다소 적절하지 않은 부분이 있기는 하나 결론을 수긍할 수 있고 법리오해나 필요한 심리를 다하지 않은 잘못이 없다고 보았습니다. 의료장비 사업 부문에서는 유지보수서비스 지원 거래가 의료장비 공급 거래와 별도로 독립적인 거래였다고 보기 어렵고, 그러한 이상 피고가 그 거래를 조정 대상 국제거래로 특정하고 비교 가능성을 평가하는 과정을 반드시 거쳤어야 한다고 볼 수 없으므로 원심 판단은 수긍하기 어렵다고 하였습니다. 피고가 해외 제조 의료기기 등의 국내 독점 판매권한을 보유하고 장비 판매 후 유상 유지보수서비스로 추가 수익을 창출하는 업체들을 비교대상업체로 선정하였다면 정당한 세액을 새로 산출할 필요가 있으므로 원심판결을 전부 파기하고 서울고등법원에 환송했으며, 관여 대법관의 일치된 의견으로 판결했습니다.

선례 적용 시 구별할 사안의 경계(Distinguishing)

  • 국외특수관계자거래와 비교대상거래 사이에 상품이나 거래단계의 차이가 현저하여 양자가 본질적으로 다르고, 다른 비교 가능성 분석요소의 차이를 야기하며 영업이익률에 중대한 영향을 미치는데 합리적인 차이 조정이 이루어지지 않은 경우
  • 유지보수서비스 지원에 관하여 별도의 계약서가 작성되고 그 대가가 독립된 항목으로 지급되어 별도의 비교 가능성 평가가 필요한 독립적인 국제거래인 경우
  • 과세관청이 유사한 거래를 행하는 비교대상업체를 선정하지 않았거나 최선의 노력으로 확보한 자료에 기하여 합리적으로 정상가격을 산출하지 않은 경우

기록 대조 및 검토 사항

유지보수서비스 지원 거래를 독립적인 거래로 보려면 대법원이 근거로 삼은 두 가지, 별도의 계약서가 없고 그 대가가 독립된 항목으로 지급되지 않았다는 점을 먼저 대조해 봅니다. 이어 원고의 매출 구성, 유지보수 업무에서 엔지니어의 기술 및 숙련도의 비중, 선정된 비교대상업체들의 특성을 대법원이 든 요소들과 맞춰 봅니다. 마지막으로 적용 법령을 확인합니다. 이 판결은 2017. 12. 19. 법률 제15221호로 개정되기 전의 구 국제조세조정법과 2019. 2. 12. 대통령령 제29525호로 개정되기 전의 구 시행령을 적용하였고, 현행법상 그 자리는 법 제7조 제1항·제2항, 제8조와 시행령 제14조가 맡고 있습니다.

판결 원문 발췌

판시사항

[1] 구 국제조세조정에 관한 법률상 정상가격 산출방법 중 하나인 거래순이익률방법의 특징 / 국외특수관계자거래와 비교대상거래 사이에 상품이나 거래단계의 차이가 현저하여 양자가 본질적으로 달라 다른 비교 가능성 분석요소의 차이를 야기하며, 그러한 차이가 영업이익률에 중대한 영향을 미치는 경우, 그러한 비교대상거래를 기초로 거래순이익률방법에 따라 산출한 가격이 적법한 정상가격인지 여부(소극) [2] 과세관청이 당해 거래의 조건과 상황이 유사한 거래를 행하는 비교대상업체를 선정하고 최선의 노력으로 확보한 자료에 기하여 합리적으로 구 국제조세조정에 관한 법률상 거래순이익률방법을 적용하여 정상가격을 산출한 경우, 거래품목이나 비교대상업체와의 거래단계 등 차이에 따른 별도의 조정을 하지 아니하였다는 이유만으로 그와 같이 산출한 정상가격이 틀렸다고 단정할 수는 있는지 여부(원칙적 소극) [3] 갑 주식회사가 모회사인 다국적 기업의 그룹에 속한 국외특수관계인들로부터 의료장비를 수입하여 국내 시장에 판매하였는데, 갑 회사가 이를 정상가격보다 고가로 매입하였다고 보아 관할 세무서장이 익금산입 조정하여 법인세를 경정·고지한 사안에서, 제반 사정에 비추어 관할 세무서장이 갑 회사와 비슷한 거래를 행하는 비교대상업체를 선정하고 최선의 노력으로 확보한 자료에 기초하여 합리적으로 정상가격을 산출하였다고 볼 여지가 충분하다는 이유로, 이와 달리 본 원심판단에 법리오해 등의 잘못이 있다고 한 사례

판결요지

[1] 거래순이익률방법은 매출원가 및 판매비와 일반관리비 등 영업비용이 반영된 순이익률지표 또는 영업이익률에 기초하여 정상가격을 산출하는 것이므로, 다른 정상가격 산출방법 중 거래가격에 기초하는 ‘비교가능 제3자 가격방법’이나 매출총이익률에 기초하는 ‘재판매가격방법’ 또는 ‘원가가산방법’과 달리 상품의 차이나 거래단계 등 사업활동의 기능상 차이 등에 의한 영향이 적다. 다만 국외특수관계자거래와 비교대상거래 사이에 상품이나 거래단계의 차이가 현저하여 양자가 본질적으로 다르고, 그로 인하여 거래에 수반되는 위험이나 사용되는 자산 등 다른 비교 가능성 분석요소의 차이를 야기하며, 나아가 그러한 차이가 영업이익률에 중대한 영향을 미친다면, 그 비교대상거래는 합리적인 차이 조정이 이루어지지 아니하는 한 비교 가능성이 높다고 할 수 없어 당해 거래의 조건과 상황이 유사한 거래라고 할 수 없으므로, 그러한 비교대상거래를 기초로 거래순이익률방법에 따라 산출한 가격은 적법한 정상가격이라고 할 수 없다. [2] 거래순이익률방법을 적용하여 정상가격을 산출하는 경우, 과세관청이 당해 거래의 조건과 상황이 유사한 거래를 행하는 비교대상업체를 선정하고 최선의 노력으로 확보한 자료에 기하여 합리적으로 정상가격을 산출하였다면, 특별한 사정이 없는 한 거래품목이나 비교대상업체와의 거래단계 등 차이에 따른 별도의 조정을 하지 아니하였다는 이유만으로 그와 같이 산출한 정상가격이 틀렸다고 단정할 수는 없다. [3] 갑 주식회사가 모회사인 다국적 기업의 그룹에 속한 국외특수관계인들로부터 의료장비를 수입하여 국내 시장에 판매하였는데, 갑 회사가 이를 정상가격보다 고가로 매입하였다고 보아 관할 세무서장이 익금산입 조정하여 법인세를 경정·고지한 사안에서, 갑 회사의 유지보수서비스업 매출은 대부분 유지보수서비스 용역 자체가 아니라 부품 판매에서 발생하였고, 유지보수서비스 용역을 제공하는 과정에서도 의료장비 제조사로부터 제공받은 기술적 정보 자체보다 유지보수 업무를 수행하는 엔지니어의 기술 및 숙련도가 더 중요하였는데 대부분의 의료장비 고장은 국내 엔지니어들에 의해 해결되는 등 ‘유지보수서비스 지원 거래’라는 것이 국내에서의 유지보수서비스업과 관련된 다국적기업 차원의 기본적 제도 및 정책에 불과한 점, 갑 회사와 국외특수관계인들은 의료장비 및 부품 공급 거래를 할 때와 달리 ‘유지보수서비스 지원’에 관해서는 계약서를 따로 작성하지 않은 점 등을 종합하면, 갑 회사와 국외특수관계인들 사이에 의료장비 공급 거래와 별도로 독립적인 ‘유지보수서비스 지원 거래’가 존재하였다고 보기 어렵고, 관할 세무서장이 비교대상업체를 선정하기에 앞서 ‘유지보수서비스 지원 거래’를 조정 대상 국제거래로 특정하고 비교 가능성을 평가하는 과정을 반드시 거쳤어야 한다고 볼 수 없으므로, 관할 세무서장이 해외 제조 의료기기 등의 국내 독점 판매권한을 보유하고 있는 기업들로서 장비 판매 후 유상 유지보수서비스 사업을 통해 추가 수익을 창출하는 업체들을 비교대상업체로 선정하였다면 이는 갑 회사와 비슷한 거래를 행하는 비교대상업체를 선정하고 최선의 노력으로 확보한 자료에 기초하여 합리적으로 정상가격을 산출하였다고 볼 여지가 충분하다는 이유로, 이와 달리 본 원심판단에 구 국제조세조정에 관한 법률(2017. 12. 19. 법률 제15221호로 개정되기 전의 것)상 거래순이익률방법에 따른 정상가격의 산출 등에 관한 법리오해 등의 잘못이 있다고 한 사례.

주문

원심판결을 파기하고, 사건을 서울고등법원에 환송한다.

참조조문

[1] 구 국제조세조정에 관한 법률(2017. 12. 19. 법률 제15221호로 개정되기 전의 것) 제4조 제1항(현행 제7조 제1항, 제2항 참조), 제5조(현행 제8조 참조), 구 국제조세조정에 관한 법률 시행령(2019. 2. 12. 대통령령 제29525호로 개정되기 전의 것) 제5조 제1항 제1호(현행 제14조 제1항 제1호 참조), 제2항(현행 제14조 제2항 참조) / [2] 구 국제조세조정에 관한 법률(2017. 12. 19. 법률 제15221호로 개정되기 전의 것) 제4조 제1항(현행 제7조 제1항, 제2항 참조), 제5조(현행 제8조 참조), 구 국제조세조정에 관한 법률 시행령(2019. 2. 12. 대통령령 제29525호로 개정되기 전의 것) 제5조 제1항 제1호(현행 제14조 제1항 제1호 참조), 제2항(현행 제14조 제2항 참조) / [3] 구 국제조세조정에 관한 법률(2017. 12. 19. 법률 제15221호로 개정되기 전의 것) 제4조 제1항(현행 제7조 제1항, 제2항 참조), 제5조(현행 제8조 참조), 구 국제조세조정에 관한 법률 시행령(2019. 2. 12. 대통령령 제29525호로 개정되기 전의 것) 제5조 제1항 제1호(현행 제14조 제1항 제1호 참조), 제2항(현행 제14조 제2항 참조)

판독 2026-10-24 · 교차 판독 2026-10-24. 인용 구절을 모두 판결 원문과 대조했습니다. 판결문이 한자로 쓴 가명은 한글 읽기(갑, 을, 병)로 옮기고, 한자 괄호 풀이는 뺐습니다.

인용한 구절이 모두 판결 원문과 한 글자씩 일치하는지 대조를 마친 기록만 싣고, 다른 계열 AI의 독립 판독으로 8개 축 전체를 교차 검증합니다. 두 계열 판독이 일치한 축과 판결문 문언의 초점에 따라 해석이 갈린 축을 모두 투명하게 공개합니다. 이 대장은 연구 기록이며, 법원에 대한 평가나 특정 사건에 대한 조언이 아닙니다.

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